Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Traf3Q60803 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms