Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ggnbp2Q5SV77 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms