Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Mdc1Q5PSV9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdc1Q5PSV9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdc1Q5PSV9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdc1Q5PSV9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Mdc1Q5PSV9 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Mdc1Q5PSV9 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Mdc1Q5PSV9 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Mdc1Q5PSV9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Mdc1Q5PSV9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Mdc1Q5PSV9 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Mdc1Q5PSV9 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mdc1Q5PSV9 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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