Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ecm2Q5FW85 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms