Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

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Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Tnni1-208ENSMUST00000154463 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gm20616-201ENSMUST00000177262 716 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 AC116596.1-201ENSMUST00000228112 1762 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Hspa12b-202ENSMUST00000100763 628 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Herc2Q4U2R1 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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