Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Fam220aQ3ZN08 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam220aQ3ZN08 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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