Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmub2Q3V209 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms