Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc27Q3V036 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms