Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn4Q3UWL8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms