Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Znf48Q3US17 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Znf48Q3US17 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Znf48Q3US17 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Znf48Q3US17 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Znf48Q3US17 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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