Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UPC7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UPC7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UPC7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms