Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Tmem253Q3UNB8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Tmem253Q3UNB8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Tmem253Q3UNB8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Tmem253Q3UNB8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Tmem253Q3UNB8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Tmem253Q3UNB8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Tmem253Q3UNB8 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Tmem253Q3UNB8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Tmem253Q3UNB8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem253Q3UNB8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms