Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b2Q3UJB0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms