Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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