Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hdhd2Q3UGR5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdhd2Q3UGR5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdhd2Q3UGR5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdhd2Q3UGR5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdhd2Q3UGR5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdhd2Q3UGR5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdhd2Q3UGR5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdhd2Q3UGR5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdhd2Q3UGR5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdhd2Q3UGR5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms