Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Q3U6N9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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