Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
YrdcQ3U5F4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms