Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf40Q3U319 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf40Q3U319 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf40Q3U319 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rnf40Q3U319 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf40Q3U319 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rnf40Q3U319 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rnf40Q3U319 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms