Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trappc9Q3U0M1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms