Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nlrp1aQ2LKU9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nlrp1aQ2LKU9 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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