Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd11Q1RNF8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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