Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Perm1Q149B8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms