Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rundc1Q0VDN7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms