Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TrioQ0KL02 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms