Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnma1Q08460 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms