Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Tff1Q08423 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Tff1Q08423 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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