Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm3Q08189 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms