Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms