Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms