Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MestQ07646 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
MestQ07646 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
MestQ07646 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
MestQ07646 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
MestQ07646 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MestQ07646 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MestQ07646 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms