Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
NrepQ07475 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
NrepQ07475 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NrepQ07475 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms