Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms