Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cab39Q06138 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms