Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm12460-201ENSMUST00000117147 357 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm5307-201ENSMUST00000204772 760 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 AC155259.1-201ENSMUST00000214794 477 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Olfr1115-201ENSMUST00000081986 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm8048-201ENSMUST00000182555 996 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox12Q04890 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms