Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnb1Q03717 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms