Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms