Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms