Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfiaQ02780 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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