Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms