Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mc1rQ01727 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms