Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top2aQ01320 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms