Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EgfrQ01279 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms