Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Grin2cQ01098 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms