Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2bQ01097 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms