Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms