Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoa1Q00623 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms