Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Otx1P80205 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms