Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
UbdP63072 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
UbdP63072 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
UbdP63072 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
UbdP63072 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
UbdP63072 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
UbdP63072 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
UbdP63072 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
UbdP63072 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
UbdP63072 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
UbdP63072 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
UbdP63072 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
UbdP63072 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
UbdP63072 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
UbdP63072 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
UbdP63072 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
UbdP63072 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms