Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms