Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gsc2P56916 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gsc2P56916 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gsc2P56916 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gsc2P56916 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gsc2P56916 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gsc2P56916 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Gsc2P56916 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Gsc2P56916 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gsc2P56916 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms